molcas_7.4-ompi-iqtc04.sub

#!/bin/bash 
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# SGE options and parameters
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# (1) Name of the job 
#$ -N MOLCAS-mpi-ncores
# (2) Requested resources 
# Parallel Environment and number of cores
#$ -pe omp* 12
# Queue
#$ -q iqtc04.q
# Shell
#$ -S /bin/bash
# (3) Output files 
#$ -cwd 
#$ -o molcas-mpi-TEST-ncores.out 
#$ -e molcas-mpi-TEST-ncores.err 
# (4) Remove the first '#' of the following 2 lines if you want to receive an email when the job ends.
##$ -m e 
##$ -M yourmail@ub.edu
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# User environment. 
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# Load the modules needed 
. /etc/profile.d/modules.sh
module load molcas/7.4_patch045_serial_ics-11.1.072_mkl-11.1.072_ompi-1.4.2
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# Copying files needed 
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# We copy the inputs to the directory where the jobs will run 
cd $TMPDIR
cp -r $HOME/bench/MOLCAS/XRQTC.Molcas_caspt2/*  .
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# Run the job 
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export OMP_NUM_THREADS=1
export CPUS=$NSLOTS
#export MOLCASMEM=47104
molcas "MOLCAS.inputmol" >> "MOLCAS.out"
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# Copy the results to our home directory
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mkdir -p $HOME/bench/MOLCAS/OUT/molcas
#cp -r * $HOME/bench/MOLCAS/OUT/molcas
cp -r $TMPDIR $HOME/bench/MOLCAS/OUT/molcas/